Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3558Q5FWC9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3558Q5FWC9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3558Q5FWC9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm3558Q5FWC9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3558Q5FWC9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3558Q5FWC9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3558Q5FWC9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms