Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
Pds5bQ4VA53 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC45■■■■■ 4.79
Pds5bQ4VA53 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
Pds5bQ4VA53 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Pds5bQ4VA53 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Pds5bQ4VA53 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Pds5bQ4VA53 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Pds5bQ4VA53 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC44.96■■■■■ 4.79
Pds5bQ4VA53 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.79
Pds5bQ4VA53 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Pds5bQ4VA53 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
Pds5bQ4VA53 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Pds5bQ4VA53 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Pds5bQ4VA53 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Pds5bQ4VA53 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Pds5bQ4VA53 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Pds5bQ4VA53 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Pds5bQ4VA53 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Pds5bQ4VA53 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Pds5bQ4VA53 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
Pds5bQ4VA53 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
Pds5bQ4VA53 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
Pds5bQ4VA53 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Pds5bQ4VA53 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Pds5bQ4VA53 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Pds5bQ4VA53 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
Pds5bQ4VA53 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
Pds5bQ4VA53 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
Pds5bQ4VA53 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Pds5bQ4VA53 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
Pds5bQ4VA53 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC44.77■■■■■ 4.76
Pds5bQ4VA53 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Pds5bQ4VA53 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Pds5bQ4VA53 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Pds5bQ4VA53 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.76
Pds5bQ4VA53 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.76
Pds5bQ4VA53 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC44.75■■■■■ 4.76
Pds5bQ4VA53 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Pds5bQ4VA53 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Pds5bQ4VA53 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Pds5bQ4VA53 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
Pds5bQ4VA53 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
Pds5bQ4VA53 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
Pds5bQ4VA53 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Pds5bQ4VA53 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
Pds5bQ4VA53 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
Pds5bQ4VA53 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Pds5bQ4VA53 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
Pds5bQ4VA53 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Pds5bQ4VA53 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Pds5bQ4VA53 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
Pds5bQ4VA53 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Pds5bQ4VA53 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Pds5bQ4VA53 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.72
Pds5bQ4VA53 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Pds5bQ4VA53 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Pds5bQ4VA53 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Pds5bQ4VA53 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Pds5bQ4VA53 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Pds5bQ4VA53 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Pds5bQ4VA53 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Pds5bQ4VA53 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Pds5bQ4VA53 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Pds5bQ4VA53 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Pds5bQ4VA53 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Pds5bQ4VA53 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Pds5bQ4VA53 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Pds5bQ4VA53 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Pds5bQ4VA53 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Pds5bQ4VA53 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Pds5bQ4VA53 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Pds5bQ4VA53 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Pds5bQ4VA53 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Pds5bQ4VA53 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Pds5bQ4VA53 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Pds5bQ4VA53 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
Pds5bQ4VA53 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Pds5bQ4VA53 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC44.37■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
Pds5bQ4VA53 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Pds5bQ4VA53 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Pds5bQ4VA53 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Pds5bQ4VA53 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
Pds5bQ4VA53 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
Pds5bQ4VA53 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
Pds5bQ4VA53 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Pds5bQ4VA53 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Pds5bQ4VA53 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms