Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G4

BC030870, cDNA sequence BC030870, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030870Q3V2G4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC030870Q3V2G4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC030870Q3V2G4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC030870Q3V2G4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC030870Q3V2G4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC030870Q3V2G4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC030870Q3V2G4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC030870Q3V2G4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC030870Q3V2G4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC030870Q3V2G4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC030870Q3V2G4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC030870Q3V2G4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC030870Q3V2G4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC030870Q3V2G4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC030870Q3V2G4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC030870Q3V2G4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC030870Q3V2G4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC030870Q3V2G4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC030870Q3V2G4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC030870Q3V2G4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BC030870Q3V2G4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BC030870Q3V2G4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC030870Q3V2G4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC030870Q3V2G4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC030870Q3V2G4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC030870Q3V2G4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC030870Q3V2G4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC030870Q3V2G4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC030870Q3V2G4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC030870Q3V2G4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC030870Q3V2G4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC030870Q3V2G4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC030870Q3V2G4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC030870Q3V2G4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC030870Q3V2G4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC030870Q3V2G4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms