Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr11Q3V1L6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mtmr11Q3V1L6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mtmr11Q3V1L6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtmr11Q3V1L6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtmr11Q3V1L6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtmr11Q3V1L6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mtmr11Q3V1L6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms