Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc110Q3V125 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc110Q3V125 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc110Q3V125 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc110Q3V125 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc110Q3V125 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc110Q3V125 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc110Q3V125 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc110Q3V125 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc110Q3V125 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc110Q3V125 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc110Q3V125 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc110Q3V125 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc110Q3V125 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc110Q3V125 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc110Q3V125 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc110Q3V125 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc110Q3V125 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc110Q3V125 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc110Q3V125 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc110Q3V125 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc110Q3V125 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc110Q3V125 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc110Q3V125 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc110Q3V125 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc110Q3V125 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc110Q3V125 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc110Q3V125 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc110Q3V125 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc110Q3V125 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc110Q3V125 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc110Q3V125 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc110Q3V125 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc110Q3V125 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms