Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zmat1Q3V0C1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zmat1Q3V0C1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zmat1Q3V0C1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zmat1Q3V0C1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zmat1Q3V0C1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zmat1Q3V0C1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zmat1Q3V0C1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zmat1Q3V0C1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zmat1Q3V0C1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zmat1Q3V0C1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zmat1Q3V0C1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zmat1Q3V0C1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zmat1Q3V0C1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zmat1Q3V0C1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zmat1Q3V0C1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zmat1Q3V0C1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmat1Q3V0C1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmat1Q3V0C1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmat1Q3V0C1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmat1Q3V0C1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmat1Q3V0C1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmat1Q3V0C1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zmat1Q3V0C1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zmat1Q3V0C1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zmat1Q3V0C1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zmat1Q3V0C1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zmat1Q3V0C1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zmat1Q3V0C1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms