Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SvipQ3UZP4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvipQ3UZP4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvipQ3UZP4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms