Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc38a11Q3USY0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc38a11Q3USY0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc38a11Q3USY0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a11Q3USY0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc38a11Q3USY0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc38a11Q3USY0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc38a11Q3USY0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc38a11Q3USY0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a11Q3USY0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc38a11Q3USY0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc38a11Q3USY0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc38a11Q3USY0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc38a11Q3USY0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc38a11Q3USY0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc38a11Q3USY0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc38a11Q3USY0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc38a11Q3USY0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc38a11Q3USY0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc38a11Q3USY0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc38a11Q3USY0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc38a11Q3USY0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc38a11Q3USY0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc38a11Q3USY0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc38a11Q3USY0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc38a11Q3USY0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc38a11Q3USY0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms