Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm28047Q3US59 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm28047Q3US59 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm28047Q3US59 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm28047Q3US59 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm28047Q3US59 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm28047Q3US59 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm28047Q3US59 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm28047Q3US59 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm28047Q3US59 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm28047Q3US59 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm28047Q3US59 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm28047Q3US59 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm28047Q3US59 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm28047Q3US59 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm28047Q3US59 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm28047Q3US59 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm28047Q3US59 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm28047Q3US59 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm28047Q3US59 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm28047Q3US59 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm28047Q3US59 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm28047Q3US59 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm28047Q3US59 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm28047Q3US59 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm28047Q3US59 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm28047Q3US59 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm28047Q3US59 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm28047Q3US59 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm28047Q3US59 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm28047Q3US59 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm28047Q3US59 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm28047Q3US59 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm28047Q3US59 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm28047Q3US59 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm28047Q3US59 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gm28047Q3US59 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm28047Q3US59 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm28047Q3US59 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm28047Q3US59 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm28047Q3US59 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm28047Q3US59 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm28047Q3US59 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm28047Q3US59 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm28047Q3US59 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm28047Q3US59 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm28047Q3US59 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm28047Q3US59 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gm28047Q3US59 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm28047Q3US59 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm28047Q3US59 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm28047Q3US59 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm28047Q3US59 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm28047Q3US59 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm28047Q3US59 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm28047Q3US59 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm28047Q3US59 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm28047Q3US59 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm28047Q3US59 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm28047Q3US59 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm28047Q3US59 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm28047Q3US59 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm28047Q3US59 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms