Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNA4

Nxt2, NTF2-related export protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxt2Q3UNA4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nxt2Q3UNA4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nxt2Q3UNA4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nxt2Q3UNA4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Nxt2Q3UNA4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nxt2Q3UNA4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nxt2Q3UNA4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nxt2Q3UNA4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nxt2Q3UNA4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nxt2Q3UNA4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nxt2Q3UNA4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nxt2Q3UNA4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxt2Q3UNA4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxt2Q3UNA4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nxt2Q3UNA4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nxt2Q3UNA4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nxt2Q3UNA4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nxt2Q3UNA4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nxt2Q3UNA4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxt2Q3UNA4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxt2Q3UNA4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nxt2Q3UNA4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxt2Q3UNA4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxt2Q3UNA4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxt2Q3UNA4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms