Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc34Q3UI66 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc34Q3UI66 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc34Q3UI66 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc34Q3UI66 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc34Q3UI66 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc34Q3UI66 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc34Q3UI66 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc34Q3UI66 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc34Q3UI66 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc34Q3UI66 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc34Q3UI66 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc34Q3UI66 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc34Q3UI66 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc34Q3UI66 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc34Q3UI66 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc34Q3UI66 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms