Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Hdhd2Q3UGR5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Hdhd2Q3UGR5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Hdhd2Q3UGR5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Hdhd2Q3UGR5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
Hdhd2Q3UGR5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Hdhd2Q3UGR5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Hdhd2Q3UGR5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Hdhd2Q3UGR5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Hdhd2Q3UGR5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Hdhd2Q3UGR5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Hdhd2Q3UGR5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Hdhd2Q3UGR5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Hdhd2Q3UGR5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Hdhd2Q3UGR5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Hdhd2Q3UGR5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Hdhd2Q3UGR5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Hdhd2Q3UGR5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Hdhd2Q3UGR5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Hdhd2Q3UGR5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Hdhd2Q3UGR5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Hdhd2Q3UGR5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Hdhd2Q3UGR5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Hdhd2Q3UGR5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Hdhd2Q3UGR5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Hdhd2Q3UGR5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Hdhd2Q3UGR5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Hdhd2Q3UGR5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Hdhd2Q3UGR5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Hdhd2Q3UGR5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hdhd2Q3UGR5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hdhd2Q3UGR5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hdhd2Q3UGR5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hdhd2Q3UGR5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hdhd2Q3UGR5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
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Hdhd2Q3UGR5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
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Hdhd2Q3UGR5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Hdhd2Q3UGR5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
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Hdhd2Q3UGR5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Hdhd2Q3UGR5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Hdhd2Q3UGR5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Hdhd2Q3UGR5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Hdhd2Q3UGR5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Hdhd2Q3UGR5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Hdhd2Q3UGR5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Hdhd2Q3UGR5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
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Hdhd2Q3UGR5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Hdhd2Q3UGR5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Hdhd2Q3UGR5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Hdhd2Q3UGR5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Hdhd2Q3UGR5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Hdhd2Q3UGR5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Hdhd2Q3UGR5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Hdhd2Q3UGR5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Hdhd2Q3UGR5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Hdhd2Q3UGR5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Hdhd2Q3UGR5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Hdhd2Q3UGR5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Hdhd2Q3UGR5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Hdhd2Q3UGR5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Hdhd2Q3UGR5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,1 ms