Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brf2Q3UAW9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf2Q3UAW9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf2Q3UAW9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brf2Q3UAW9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf2Q3UAW9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf2Q3UAW9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf2Q3UAW9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brf2Q3UAW9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brf2Q3UAW9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brf2Q3UAW9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brf2Q3UAW9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Brf2Q3UAW9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf2Q3UAW9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf2Q3UAW9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf2Q3UAW9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brf2Q3UAW9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf2Q3UAW9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brf2Q3UAW9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf2Q3UAW9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brf2Q3UAW9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brf2Q3UAW9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brf2Q3UAW9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brf2Q3UAW9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf2Q3UAW9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brf2Q3UAW9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brf2Q3UAW9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brf2Q3UAW9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brf2Q3UAW9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brf2Q3UAW9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brf2Q3UAW9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brf2Q3UAW9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brf2Q3UAW9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brf2Q3UAW9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brf2Q3UAW9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brf2Q3UAW9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms