Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trip13Q3UA06 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trip13Q3UA06 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trip13Q3UA06 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trip13Q3UA06 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trip13Q3UA06 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trip13Q3UA06 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trip13Q3UA06 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trip13Q3UA06 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trip13Q3UA06 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trip13Q3UA06 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trip13Q3UA06 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trip13Q3UA06 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trip13Q3UA06 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trip13Q3UA06 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip13Q3UA06 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip13Q3UA06 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip13Q3UA06 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip13Q3UA06 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip13Q3UA06 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip13Q3UA06 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms