Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3U595 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3U595 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3U595 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3U595 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3U595 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3U595 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3U595 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3U595 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3U595 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3U595 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3U595 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3U595 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3U595 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3U595 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3U595 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3U595 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3U595 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3U595 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U595 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U595 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U595 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U595 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U595 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3U595 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3U595 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3U595 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3U595 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3U595 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3U595 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3U595 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3U595 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3U595 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3U595 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U595 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U595 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U595 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U595 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U595 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U595 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U595 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3U595 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3U595 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3U595 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3U595 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3U595 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3U595 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3U595 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3U595 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3U595 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U595 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U595 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U595 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U595 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U595 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3U595 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3U595 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3U595 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3U595 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3U595 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3U595 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U595 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U595 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U595 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U595 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U595 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U595 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U595 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q3U595 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q3U595 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q3U595 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q3U595 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q3U595 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q3U595 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q3U595 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U595 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U595 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U595 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U595 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U595 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U595 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q3U595 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q3U595 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q3U595 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q3U595 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q3U595 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q3U595 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q3U595 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q3U595 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q3U595 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q3U595 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q3U595 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q3U595 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q3U595 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q3U595 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q3U595 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q3U595 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q3U595 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q3U595 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q3U595 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms