Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl21Q3U410 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl21Q3U410 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl21Q3U410 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl21Q3U410 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl21Q3U410 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl21Q3U410 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl21Q3U410 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl21Q3U410 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl21Q3U410 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl21Q3U410 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl21Q3U410 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Klhl21Q3U410 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klhl21Q3U410 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl21Q3U410 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhl21Q3U410 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl21Q3U410 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl21Q3U410 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms