Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam117bQ3U3E2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam117bQ3U3E2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms