Protein–RNA interactions for Protein: Q3U095

Nxpe2, NXPE family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe2Q3U095 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxpe2Q3U095 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxpe2Q3U095 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxpe2Q3U095 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxpe2Q3U095 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxpe2Q3U095 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxpe2Q3U095 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxpe2Q3U095 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxpe2Q3U095 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxpe2Q3U095 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nxpe2Q3U095 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nxpe2Q3U095 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxpe2Q3U095 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxpe2Q3U095 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxpe2Q3U095 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxpe2Q3U095 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nxpe2Q3U095 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nxpe2Q3U095 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nxpe2Q3U095 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nxpe2Q3U095 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxpe2Q3U095 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxpe2Q3U095 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxpe2Q3U095 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxpe2Q3U095 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxpe2Q3U095 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nxpe2Q3U095 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxpe2Q3U095 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxpe2Q3U095 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nxpe2Q3U095 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nxpe2Q3U095 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nxpe2Q3U095 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nxpe2Q3U095 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nxpe2Q3U095 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms