Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trmt1Q3TX08 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trmt1Q3TX08 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trmt1Q3TX08 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trmt1Q3TX08 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trmt1Q3TX08 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trmt1Q3TX08 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trmt1Q3TX08 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trmt1Q3TX08 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trmt1Q3TX08 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trmt1Q3TX08 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trmt1Q3TX08 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trmt1Q3TX08 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trmt1Q3TX08 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trmt1Q3TX08 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trmt1Q3TX08 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trmt1Q3TX08 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trmt1Q3TX08 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trmt1Q3TX08 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Trmt1Q3TX08 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trmt1Q3TX08 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trmt1Q3TX08 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trmt1Q3TX08 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trmt1Q3TX08 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trmt1Q3TX08 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Trmt1Q3TX08 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trmt1Q3TX08 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trmt1Q3TX08 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trmt1Q3TX08 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trmt1Q3TX08 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trmt1Q3TX08 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trmt1Q3TX08 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trmt1Q3TX08 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trmt1Q3TX08 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trmt1Q3TX08 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trmt1Q3TX08 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trmt1Q3TX08 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trmt1Q3TX08 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trmt1Q3TX08 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Trmt1Q3TX08 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trmt1Q3TX08 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trmt1Q3TX08 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trmt1Q3TX08 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trmt1Q3TX08 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trmt1Q3TX08 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trmt1Q3TX08 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trmt1Q3TX08 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trmt1Q3TX08 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trmt1Q3TX08 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trmt1Q3TX08 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trmt1Q3TX08 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trmt1Q3TX08 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trmt1Q3TX08 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trmt1Q3TX08 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trmt1Q3TX08 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Trmt1Q3TX08 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trmt1Q3TX08 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trmt1Q3TX08 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms