Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3TTL0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3TTL0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q3TTL0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3TTL0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3TTL0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3TTL0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3TTL0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3TTL0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3TTL0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3TTL0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3TTL0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3TTL0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3TTL0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3TTL0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3TTL0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3TTL0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3TTL0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3TTL0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3TTL0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3TTL0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3TTL0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3TTL0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3TTL0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3TTL0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3TTL0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3TTL0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3TTL0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3TTL0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3TTL0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3TTL0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3TTL0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3TTL0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3TTL0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3TTL0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3TTL0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3TTL0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3TTL0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3TTL0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3TTL0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3TTL0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3TTL0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3TTL0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3TTL0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3TTL0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3TTL0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3TTL0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3TTL0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3TTL0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3TTL0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3TTL0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3TTL0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3TTL0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3TTL0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3TTL0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3TTL0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3TTL0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3TTL0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3TTL0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms