Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr27Q3SYJ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr27Q3SYJ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr27Q3SYJ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr27Q3SYJ2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr27Q3SYJ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr27Q3SYJ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr27Q3SYJ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr27Q3SYJ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr27Q3SYJ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr27Q3SYJ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr27Q3SYJ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr27Q3SYJ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr27Q3SYJ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prr27Q3SYJ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr27Q3SYJ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr27Q3SYJ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr27Q3SYJ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr27Q3SYJ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prr27Q3SYJ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prr27Q3SYJ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prr27Q3SYJ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Prr27Q3SYJ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prr27Q3SYJ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prr27Q3SYJ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prr27Q3SYJ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prr27Q3SYJ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prr27Q3SYJ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms