Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Trpm1Q2TV84 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Trpm1Q2TV84 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36,49■■■■□ 3,43
Trpm1Q2TV84 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Trpm1Q2TV84 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36,46■■■■□ 3,43
Trpm1Q2TV84 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Trpm1Q2TV84 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Trpm1Q2TV84 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Trpm1Q2TV84 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Trpm1Q2TV84 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36,4■■■■□ 3,42
Trpm1Q2TV84 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36,38■■■■□ 3,41
Trpm1Q2TV84 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Trpm1Q2TV84 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Trpm1Q2TV84 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Trpm1Q2TV84 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36,34■■■■□ 3,41
Trpm1Q2TV84 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Trpm1Q2TV84 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Trpm1Q2TV84 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36,27■■■■□ 3,4
Trpm1Q2TV84 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Trpm1Q2TV84 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Trpm1Q2TV84 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Trpm1Q2TV84 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Trpm1Q2TV84 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36,23■■■■□ 3,39
Trpm1Q2TV84 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Trpm1Q2TV84 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36,23■■■■□ 3,39
Trpm1Q2TV84 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36,22■■■■□ 3,39
Trpm1Q2TV84 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Trpm1Q2TV84 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Trpm1Q2TV84 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Trpm1Q2TV84 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Trpm1Q2TV84 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Trpm1Q2TV84 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Trpm1Q2TV84 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Trpm1Q2TV84 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Trpm1Q2TV84 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Trpm1Q2TV84 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Trpm1Q2TV84 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36,12■■■■□ 3,37
Trpm1Q2TV84 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36,11■■■■□ 3,37
Trpm1Q2TV84 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Trpm1Q2TV84 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Trpm1Q2TV84 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Trpm1Q2TV84 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Trpm1Q2TV84 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Trpm1Q2TV84 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Trpm1Q2TV84 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Trpm1Q2TV84 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36,04■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36,04■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36,02■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Trpm1Q2TV84 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,35
Trpm1Q2TV84 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,35
Trpm1Q2TV84 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3,35
Trpm1Q2TV84 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Trpm1Q2TV84 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Trpm1Q2TV84 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Trpm1Q2TV84 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Trpm1Q2TV84 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Trpm1Q2TV84 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Trpm1Q2TV84 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Trpm1Q2TV84 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Trpm1Q2TV84 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Trpm1Q2TV84 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Trpm1Q2TV84 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Trpm1Q2TV84 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Trpm1Q2TV84 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Trpm1Q2TV84 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Trpm1Q2TV84 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Trpm1Q2TV84 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Trpm1Q2TV84 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Trpm1Q2TV84 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Trpm1Q2TV84 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35,9■■■■□ 3,34
Trpm1Q2TV84 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35,89■■■■□ 3,34
Trpm1Q2TV84 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Trpm1Q2TV84 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35,86■■■■□ 3,33
Trpm1Q2TV84 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Trpm1Q2TV84 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Trpm1Q2TV84 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Trpm1Q2TV84 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Trpm1Q2TV84 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Trpm1Q2TV84 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Trpm1Q2TV84 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Trpm1Q2TV84 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Trpm1Q2TV84 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Trpm1Q2TV84 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Trpm1Q2TV84 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Trpm1Q2TV84 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Trpm1Q2TV84 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Trpm1Q2TV84 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Trpm1Q2TV84 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Trpm1Q2TV84 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms