Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vax1Q2NKI2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vax1Q2NKI2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vax1Q2NKI2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vax1Q2NKI2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vax1Q2NKI2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vax1Q2NKI2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vax1Q2NKI2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vax1Q2NKI2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vax1Q2NKI2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vax1Q2NKI2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vax1Q2NKI2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vax1Q2NKI2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vax1Q2NKI2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vax1Q2NKI2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vax1Q2NKI2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vax1Q2NKI2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms