Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms