Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Col19a1Q0VF58 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Col19a1Q0VF58 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Col19a1Q0VF58 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Col19a1Q0VF58 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Col19a1Q0VF58 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Col19a1Q0VF58 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Col19a1Q0VF58 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Col19a1Q0VF58 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Col19a1Q0VF58 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Col19a1Q0VF58 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Col19a1Q0VF58 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Col19a1Q0VF58 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Col19a1Q0VF58 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Col19a1Q0VF58 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Col19a1Q0VF58 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27,08■■□□□ 1,93
Col19a1Q0VF58 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27,08■■□□□ 1,93
Col19a1Q0VF58 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Col19a1Q0VF58 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Col19a1Q0VF58 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Col19a1Q0VF58 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Col19a1Q0VF58 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Col19a1Q0VF58 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Col19a1Q0VF58 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Col19a1Q0VF58 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Col19a1Q0VF58 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Col19a1Q0VF58 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Col19a1Q0VF58 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Col19a1Q0VF58 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Col19a1Q0VF58 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Col19a1Q0VF58 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Col19a1Q0VF58 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Col19a1Q0VF58 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Col19a1Q0VF58 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Col19a1Q0VF58 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Col19a1Q0VF58 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Col19a1Q0VF58 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Col19a1Q0VF58 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Col19a1Q0VF58 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Col19a1Q0VF58 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Col19a1Q0VF58 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Col19a1Q0VF58 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Col19a1Q0VF58 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Col19a1Q0VF58 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Col19a1Q0VF58 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26,75■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Col19a1Q0VF58 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Col19a1Q0VF58 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56,5 ms