Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib3Q0P523 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cib3Q0P523 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cib3Q0P523 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cib3Q0P523 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms