Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col9a1Q05722 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col9a1Q05722 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col9a1Q05722 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col9a1Q05722 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col9a1Q05722 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col9a1Q05722 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Col9a1Q05722 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col9a1Q05722 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col9a1Q05722 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col9a1Q05722 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col9a1Q05722 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col9a1Q05722 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col9a1Q05722 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col9a1Q05722 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col9a1Q05722 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col9a1Q05722 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col9a1Q05722 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col9a1Q05722 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col9a1Q05722 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col9a1Q05722 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col9a1Q05722 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col9a1Q05722 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col9a1Q05722 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col9a1Q05722 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col9a1Q05722 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col9a1Q05722 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col9a1Q05722 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col9a1Q05722 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col9a1Q05722 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col9a1Q05722 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col9a1Q05722 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col9a1Q05722 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Col9a1Q05722 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Col9a1Q05722 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms