Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Sox12Q04890 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Sox12Q04890 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Sox12Q04890 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Sox12Q04890 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sox12Q04890 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sox12Q04890 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sox12Q04890 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sox12Q04890 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sox12Q04890 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sox12Q04890 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Sox12Q04890 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Sox12Q04890 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Sox12Q04890 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sox12Q04890 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sox12Q04890 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sox12Q04890 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sox12Q04890 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sox12Q04890 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Sox12Q04890 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Sox12Q04890 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sox12Q04890 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sox12Q04890 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sox12Q04890 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sox12Q04890 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
Sox12Q04890 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Sox12Q04890 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sox12Q04890 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sox12Q04890 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sox12Q04890 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sox12Q04890 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sox12Q04890 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sox12Q04890 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sox12Q04890 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sox12Q04890 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sox12Q04890 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Sox12Q04890 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Sox12Q04890 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sox12Q04890 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sox12Q04890 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Sox12Q04890 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Sox12Q04890 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Sox12Q04890 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Sox12Q04890 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Sox12Q04890 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Sox12Q04890 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Sox12Q04890 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Sox12Q04890 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sox12Q04890 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sox12Q04890 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sox12Q04890 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Sox12Q04890 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sox12Q04890 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sox12Q04890 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sox12Q04890 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sox12Q04890 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sox12Q04890 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sox12Q04890 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Sox12Q04890 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sox12Q04890 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sox12Q04890 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sox12Q04890 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Sox12Q04890 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Sox12Q04890 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Sox12Q04890 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Sox12Q04890 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sox12Q04890 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Sox12Q04890 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Sox12Q04890 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Sox12Q04890 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Sox12Q04890 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Sox12Q04890 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sox12Q04890 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sox12Q04890 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms