Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcad1Q04692 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarcad1Q04692 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarcad1Q04692 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarcad1Q04692 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarcad1Q04692 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarcad1Q04692 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcad1Q04692 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcad1Q04692 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcad1Q04692 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcad1Q04692 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarcad1Q04692 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarcad1Q04692 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcad1Q04692 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcad1Q04692 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcad1Q04692 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcad1Q04692 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcad1Q04692 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcad1Q04692 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcad1Q04692 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcad1Q04692 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarcad1Q04692 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcad1Q04692 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcad1Q04692 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcad1Q04692 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcad1Q04692 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcad1Q04692 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcad1Q04692 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcad1Q04692 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcad1Q04692 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcad1Q04692 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcad1Q04692 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcad1Q04692 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcad1Q04692 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcad1Q04692 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcad1Q04692 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcad1Q04692 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcad1Q04692 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcad1Q04692 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcad1Q04692 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcad1Q04692 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcad1Q04692 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcad1Q04692 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcad1Q04692 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms