Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EgfrQ01279 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EgfrQ01279 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EgfrQ01279 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EgfrQ01279 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EgfrQ01279 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EgfrQ01279 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EgfrQ01279 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EgfrQ01279 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EgfrQ01279 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EgfrQ01279 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EgfrQ01279 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EgfrQ01279 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EgfrQ01279 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EgfrQ01279 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EgfrQ01279 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EgfrQ01279 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EgfrQ01279 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EgfrQ01279 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EgfrQ01279 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EgfrQ01279 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EgfrQ01279 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EgfrQ01279 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EgfrQ01279 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EgfrQ01279 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EgfrQ01279 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EgfrQ01279 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
EgfrQ01279 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EgfrQ01279 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
EgfrQ01279 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EgfrQ01279 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EgfrQ01279 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
EgfrQ01279 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EgfrQ01279 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
EgfrQ01279 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EgfrQ01279 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EgfrQ01279 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EgfrQ01279 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EgfrQ01279 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EgfrQ01279 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EgfrQ01279 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EgfrQ01279 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EgfrQ01279 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EgfrQ01279 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EgfrQ01279 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EgfrQ01279 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EgfrQ01279 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EgfrQ01279 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EgfrQ01279 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EgfrQ01279 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EgfrQ01279 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EgfrQ01279 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EgfrQ01279 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EgfrQ01279 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EgfrQ01279 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EgfrQ01279 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EgfrQ01279 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EgfrQ01279 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EgfrQ01279 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EgfrQ01279 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EgfrQ01279 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EgfrQ01279 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EgfrQ01279 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
EgfrQ01279 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EgfrQ01279 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms