Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HmgcrQ01237 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HmgcrQ01237 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HmgcrQ01237 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HmgcrQ01237 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HmgcrQ01237 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HmgcrQ01237 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HmgcrQ01237 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HmgcrQ01237 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HmgcrQ01237 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HmgcrQ01237 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HmgcrQ01237 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HmgcrQ01237 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HmgcrQ01237 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HmgcrQ01237 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HmgcrQ01237 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HmgcrQ01237 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HmgcrQ01237 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HmgcrQ01237 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HmgcrQ01237 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HmgcrQ01237 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HmgcrQ01237 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HmgcrQ01237 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HmgcrQ01237 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HmgcrQ01237 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HmgcrQ01237 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HmgcrQ01237 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HmgcrQ01237 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HmgcrQ01237 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HmgcrQ01237 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HmgcrQ01237 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HmgcrQ01237 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HmgcrQ01237 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HmgcrQ01237 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HmgcrQ01237 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HmgcrQ01237 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HmgcrQ01237 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HmgcrQ01237 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HmgcrQ01237 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HmgcrQ01237 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HmgcrQ01237 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HmgcrQ01237 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HmgcrQ01237 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HmgcrQ01237 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HmgcrQ01237 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HmgcrQ01237 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HmgcrQ01237 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HmgcrQ01237 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HmgcrQ01237 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HmgcrQ01237 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HmgcrQ01237 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HmgcrQ01237 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HmgcrQ01237 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HmgcrQ01237 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HmgcrQ01237 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HmgcrQ01237 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HmgcrQ01237 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HmgcrQ01237 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HmgcrQ01237 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HmgcrQ01237 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HmgcrQ01237 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HmgcrQ01237 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HmgcrQ01237 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HmgcrQ01237 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HmgcrQ01237 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HmgcrQ01237 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HmgcrQ01237 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HmgcrQ01237 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HmgcrQ01237 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HmgcrQ01237 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HmgcrQ01237 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HmgcrQ01237 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HmgcrQ01237 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HmgcrQ01237 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms