Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PrcdQ00LT2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrcdQ00LT2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrcdQ00LT2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms