Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp9bP98195 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp9bP98195 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp9bP98195 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp9bP98195 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp9bP98195 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp9bP98195 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp9bP98195 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp9bP98195 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp9bP98195 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp9bP98195 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp9bP98195 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp9bP98195 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp9bP98195 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp9bP98195 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp9bP98195 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp9bP98195 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp9bP98195 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp9bP98195 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp9bP98195 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp9bP98195 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp9bP98195 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp9bP98195 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp9bP98195 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp9bP98195 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp9bP98195 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp9bP98195 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp9bP98195 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Atp9bP98195 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Atp9bP98195 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp9bP98195 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp9bP98195 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp9bP98195 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp9bP98195 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp9bP98195 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp9bP98195 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp9bP98195 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp9bP98195 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp9bP98195 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp9bP98195 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp9bP98195 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp9bP98195 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp9bP98195 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp9bP98195 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp9bP98195 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp9bP98195 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp9bP98195 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp9bP98195 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp9bP98195 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp9bP98195 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp9bP98195 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp9bP98195 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp9bP98195 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp9bP98195 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp9bP98195 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp9bP98195 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp9bP98195 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp9bP98195 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp9bP98195 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp9bP98195 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp9bP98195 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp9bP98195 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp9bP98195 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp9bP98195 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp9bP98195 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp9bP98195 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp9bP98195 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp9bP98195 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp9bP98195 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms