Protein–RNA interactions for Protein: P97461

Rps5, 40S ribosomal protein S5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps5P97461 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps5P97461 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps5P97461 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps5P97461 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps5P97461 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps5P97461 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps5P97461 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps5P97461 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps5P97461 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps5P97461 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps5P97461 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps5P97461 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps5P97461 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps5P97461 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps5P97461 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps5P97461 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps5P97461 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps5P97461 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps5P97461 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps5P97461 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps5P97461 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps5P97461 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps5P97461 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps5P97461 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps5P97461 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps5P97461 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps5P97461 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps5P97461 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps5P97461 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps5P97461 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps5P97461 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps5P97461 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps5P97461 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps5P97461 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps5P97461 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps5P97461 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps5P97461 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps5P97461 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps5P97461 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps5P97461 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps5P97461 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps5P97461 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps5P97461 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps5P97461 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps5P97461 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps5P97461 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps5P97461 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms