Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Npas2P97460 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Npas2P97460 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Npas2P97460 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Npas2P97460 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Npas2P97460 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Npas2P97460 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npas2P97460 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npas2P97460 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Npas2P97460 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Npas2P97460 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npas2P97460 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npas2P97460 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npas2P97460 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npas2P97460 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npas2P97460 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npas2P97460 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npas2P97460 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npas2P97460 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npas2P97460 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Npas2P97460 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npas2P97460 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npas2P97460 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npas2P97460 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npas2P97460 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npas2P97460 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npas2P97460 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npas2P97460 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Npas2P97460 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Npas2P97460 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npas2P97460 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npas2P97460 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npas2P97460 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npas2P97460 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npas2P97460 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npas2P97460 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npas2P97460 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npas2P97460 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npas2P97460 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npas2P97460 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Npas2P97460 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npas2P97460 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npas2P97460 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npas2P97460 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Npas2P97460 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npas2P97460 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npas2P97460 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npas2P97460 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npas2P97460 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npas2P97460 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npas2P97460 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npas2P97460 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Npas2P97460 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npas2P97460 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npas2P97460 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npas2P97460 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Npas2P97460 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Npas2P97460 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Npas2P97460 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Npas2P97460 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Npas2P97460 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Npas2P97460 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Npas2P97460 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Npas2P97460 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Npas2P97460 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Npas2P97460 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Npas2P97460 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Npas2P97460 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Npas2P97460 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Npas2P97460 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Npas2P97460 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Npas2P97460 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Npas2P97460 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npas2P97460 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npas2P97460 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npas2P97460 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npas2P97460 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Npas2P97460 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Npas2P97460 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Npas2P97460 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npas2P97460 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npas2P97460 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npas2P97460 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npas2P97460 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npas2P97460 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npas2P97460 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms