Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Npas1P97459 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Npas1P97459 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Npas1P97459 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Npas1P97459 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Npas1P97459 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Npas1P97459 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Npas1P97459 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Npas1P97459 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Npas1P97459 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas1P97459 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas1P97459 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Npas1P97459 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms