Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps3aP97351 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps3aP97351 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps3aP97351 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps3aP97351 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps3aP97351 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps3aP97351 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps3aP97351 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps3aP97351 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps3aP97351 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps3aP97351 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps3aP97351 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps3aP97351 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps3aP97351 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms