Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgcdP82347 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgcdP82347 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgcdP82347 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgcdP82347 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgcdP82347 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SgcdP82347 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgcdP82347 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgcdP82347 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SgcdP82347 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgcdP82347 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgcdP82347 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgcdP82347 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SgcdP82347 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgcdP82347 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgcdP82347 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgcdP82347 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgcdP82347 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgcdP82347 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgcdP82347 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgcdP82347 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgcdP82347 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SgcdP82347 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SgcdP82347 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgcdP82347 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SgcdP82347 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SgcdP82347 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SgcdP82347 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SgcdP82347 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SgcdP82347 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SgcdP82347 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SgcdP82347 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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