Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp4P70343 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp4P70343 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp4P70343 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp4P70343 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp4P70343 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp4P70343 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp4P70343 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp4P70343 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp4P70343 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp4P70343 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp4P70343 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp4P70343 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp4P70343 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp4P70343 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp4P70343 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp4P70343 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp4P70343 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casp4P70343 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp4P70343 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp4P70343 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casp4P70343 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Casp4P70343 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp4P70343 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp4P70343 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp4P70343 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp4P70343 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp4P70343 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp4P70343 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp4P70343 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp4P70343 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp4P70343 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp4P70343 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp4P70343 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp4P70343 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp4P70343 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp4P70343 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp4P70343 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp4P70343 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casp4P70343 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casp4P70343 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casp4P70343 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Casp4P70343 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casp4P70343 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casp4P70343 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casp4P70343 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casp4P70343 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casp4P70343 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casp4P70343 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casp4P70343 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casp4P70343 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casp4P70343 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casp4P70343 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casp4P70343 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casp4P70343 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casp4P70343 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casp4P70343 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casp4P70343 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casp4P70343 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casp4P70343 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casp4P70343 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casp4P70343 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp4P70343 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp4P70343 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp4P70343 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp4P70343 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casp4P70343 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casp4P70343 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casp4P70343 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp4P70343 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp4P70343 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms