Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Cux2P70298 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Cux2P70298 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Cux2P70298 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Cux2P70298 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Cux2P70298 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Cux2P70298 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
Cux2P70298 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Cux2P70298 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Cux2P70298 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Cux2P70298 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
Cux2P70298 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Cux2P70298 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
Cux2P70298 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Cux2P70298 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Cux2P70298 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Cux2P70298 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Cux2P70298 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Cux2P70298 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Cux2P70298 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Cux2P70298 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Cux2P70298 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Cux2P70298 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
Cux2P70298 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Cux2P70298 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Cux2P70298 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Cux2P70298 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Cux2P70298 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Cux2P70298 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Cux2P70298 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Cux2P70298 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Cux2P70298 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC41.82■■■■■ 4.28
Cux2P70298 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.28
Cux2P70298 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Cux2P70298 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Cux2P70298 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Cux2P70298 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Cux2P70298 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Cux2P70298 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Cux2P70298 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Cux2P70298 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Cux2P70298 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Cux2P70298 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Cux2P70298 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Cux2P70298 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Cux2P70298 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Cux2P70298 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Cux2P70298 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Cux2P70298 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
Cux2P70298 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Cux2P70298 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Cux2P70298 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Cux2P70298 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Cux2P70298 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC41.63■■■■■ 4.26
Cux2P70298 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Cux2P70298 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Cux2P70298 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Cux2P70298 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Cux2P70298 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Cux2P70298 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Cux2P70298 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Cux2P70298 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Cux2P70298 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Cux2P70298 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Cux2P70298 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Cux2P70298 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Cux2P70298 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Cux2P70298 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Cux2P70298 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Cux2P70298 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Cux2P70298 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Cux2P70298 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Cux2P70298 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Cux2P70298 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Cux2P70298 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Cux2P70298 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Cux2P70298 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Cux2P70298 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Cux2P70298 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Cux2P70298 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Cux2P70298 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
Cux2P70298 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Cux2P70298 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Cux2P70298 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Cux2P70298 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Cux2P70298 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Cux2P70298 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Cux2P70298 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Cux2P70298 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Cux2P70298 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Cux2P70298 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Cux2P70298 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Cux2P70298 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Cux2P70298 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Cux2P70298 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Cux2P70298 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Cux2P70298 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Cux2P70298 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Cux2P70298 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Cux2P70298 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms