Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Stra8P70278 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Stra8P70278 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Stra8P70278 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Stra8P70278 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Stra8P70278 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Stra8P70278 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33,2■■■□□ 2,91
Stra8P70278 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Stra8P70278 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Stra8P70278 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Stra8P70278 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Stra8P70278 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Stra8P70278 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Stra8P70278 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Stra8P70278 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Stra8P70278 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Stra8P70278 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Stra8P70278 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33,17■■■□□ 2,9
Stra8P70278 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Stra8P70278 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Stra8P70278 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Stra8P70278 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Stra8P70278 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33,13■■■□□ 2,89
Stra8P70278 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Stra8P70278 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Stra8P70278 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33,11■■■□□ 2,89
Stra8P70278 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Stra8P70278 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Stra8P70278 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Stra8P70278 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Stra8P70278 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Stra8P70278 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Stra8P70278 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Stra8P70278 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Stra8P70278 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Stra8P70278 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Stra8P70278 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Stra8P70278 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Stra8P70278 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Stra8P70278 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33,03■■■□□ 2,88
Stra8P70278 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33,01■■■□□ 2,88
Stra8P70278 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,01■■■□□ 2,88
Stra8P70278 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
Stra8P70278 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Stra8P70278 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Stra8P70278 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Stra8P70278 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Stra8P70278 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Stra8P70278 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Stra8P70278 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Stra8P70278 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Stra8P70278 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Stra8P70278 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Stra8P70278 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Stra8P70278 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Stra8P70278 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Stra8P70278 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Stra8P70278 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Stra8P70278 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Stra8P70278 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Stra8P70278 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Stra8P70278 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32,87■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32,83■■■□□ 2,85
Stra8P70278 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Stra8P70278 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Stra8P70278 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Stra8P70278 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Stra8P70278 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Stra8P70278 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Stra8P70278 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Stra8P70278 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32,79■■■□□ 2,84
Stra8P70278 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Stra8P70278 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Stra8P70278 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Stra8P70278 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Stra8P70278 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Stra8P70278 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Stra8P70278 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32,76■■■□□ 2,83
Stra8P70278 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Stra8P70278 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Stra8P70278 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Stra8P70278 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Stra8P70278 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32,71■■■□□ 2,83
Stra8P70278 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Stra8P70278 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32,71■■■□□ 2,83
Stra8P70278 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,71■■■□□ 2,83
Stra8P70278 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32,7■■■□□ 2,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,5 ms