Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sumo1P63166 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sumo1P63166 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sumo1P63166 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sumo1P63166 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sumo1P63166 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sumo1P63166 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sumo1P63166 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sumo1P63166 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sumo1P63166 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sumo1P63166 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sumo1P63166 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sumo1P63166 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sumo1P63166 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sumo1P63166 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sumo1P63166 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sumo1P63166 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sumo1P63166 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sumo1P63166 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sumo1P63166 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sumo1P63166 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sumo1P63166 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sumo1P63166 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sumo1P63166 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sumo1P63166 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sumo1P63166 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sumo1P63166 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sumo1P63166 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sumo1P63166 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms