Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tpm2P58774 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Tpm2P58774 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpm2P58774 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpm2P58774 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpm2P58774 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tpm2P58774 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tpm2P58774 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tpm2P58774 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpm2P58774 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tpm2P58774 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tpm2P58774 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tpm2P58774 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpm2P58774 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpm2P58774 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpm2P58774 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpm2P58774 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpm2P58774 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tpm2P58774 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tpm2P58774 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tpm2P58774 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms