Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cox17P56394 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cox17P56394 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cox17P56394 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cox17P56394 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cox17P56394 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cox17P56394 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cox17P56394 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cox17P56394 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox17P56394 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox17P56394 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox17P56394 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox17P56394 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cox17P56394 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cox17P56394 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox17P56394 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox17P56394 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cox17P56394 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cox17P56394 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms