Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5eP56382 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5eP56382 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms