Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CebpaP53566 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CebpaP53566 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CebpaP53566 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CebpaP53566 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CebpaP53566 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CebpaP53566 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CebpaP53566 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CebpaP53566 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CebpaP53566 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CebpaP53566 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CebpaP53566 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CebpaP53566 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CebpaP53566 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CebpaP53566 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CebpaP53566 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CebpaP53566 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CebpaP53566 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CebpaP53566 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CebpaP53566 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CebpaP53566 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CebpaP53566 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CebpaP53566 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CebpaP53566 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CebpaP53566 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CebpaP53566 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CebpaP53566 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CebpaP53566 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CebpaP53566 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CebpaP53566 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CebpaP53566 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CebpaP53566 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CebpaP53566 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CebpaP53566 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CebpaP53566 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CebpaP53566 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CebpaP53566 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CebpaP53566 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CebpaP53566 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CebpaP53566 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CebpaP53566 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CebpaP53566 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CebpaP53566 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CebpaP53566 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CebpaP53566 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CebpaP53566 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CebpaP53566 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CebpaP53566 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CebpaP53566 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CebpaP53566 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CebpaP53566 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CebpaP53566 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CebpaP53566 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CebpaP53566 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CebpaP53566 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CebpaP53566 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CebpaP53566 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CebpaP53566 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CebpaP53566 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CebpaP53566 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CebpaP53566 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CebpaP53566 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CebpaP53566 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CebpaP53566 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CebpaP53566 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CebpaP53566 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CebpaP53566 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CebpaP53566 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CebpaP53566 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CebpaP53566 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CebpaP53566 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CebpaP53566 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CebpaP53566 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CebpaP53566 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms