Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DbtP53395 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DbtP53395 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DbtP53395 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DbtP53395 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DbtP53395 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DbtP53395 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DbtP53395 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DbtP53395 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DbtP53395 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DbtP53395 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DbtP53395 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DbtP53395 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DbtP53395 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DbtP53395 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DbtP53395 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DbtP53395 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DbtP53395 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DbtP53395 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DbtP53395 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DbtP53395 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DbtP53395 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DbtP53395 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DbtP53395 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DbtP53395 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DbtP53395 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DbtP53395 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DbtP53395 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DbtP53395 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DbtP53395 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DbtP53395 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DbtP53395 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DbtP53395 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DbtP53395 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DbtP53395 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DbtP53395 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DbtP53395 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DbtP53395 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DbtP53395 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DbtP53395 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DbtP53395 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DbtP53395 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DbtP53395 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DbtP53395 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DbtP53395 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DbtP53395 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DbtP53395 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DbtP53395 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DbtP53395 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DbtP53395 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DbtP53395 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DbtP53395 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DbtP53395 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DbtP53395 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DbtP53395 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DbtP53395 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DbtP53395 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DbtP53395 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DbtP53395 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DbtP53395 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DbtP53395 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DbtP53395 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DbtP53395 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DbtP53395 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DbtP53395 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DbtP53395 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DbtP53395 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DbtP53395 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DbtP53395 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DbtP53395 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DbtP53395 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DbtP53395 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DbtP53395 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DbtP53395 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DbtP53395 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DbtP53395 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DbtP53395 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DbtP53395 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DbtP53395 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DbtP53395 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DbtP53395 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DbtP53395 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DbtP53395 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DbtP53395 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DbtP53395 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DbtP53395 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DbtP53395 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DbtP53395 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DbtP53395 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DbtP53395 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DbtP53395 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DbtP53395 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DbtP53395 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DbtP53395 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DbtP53395 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DbtP53395 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DbtP53395 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DbtP53395 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DbtP53395 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DbtP53395 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms