Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc1a1P51906 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc1a1P51906 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc1a1P51906 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc1a1P51906 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc1a1P51906 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc1a1P51906 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc1a1P51906 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc1a1P51906 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc1a1P51906 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc1a1P51906 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc1a1P51906 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc1a1P51906 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc1a1P51906 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc1a1P51906 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc1a1P51906 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc1a1P51906 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc1a1P51906 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc1a1P51906 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc1a1P51906 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc1a1P51906 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc1a1P51906 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc1a1P51906 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc1a1P51906 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc1a1P51906 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc1a1P51906 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc1a1P51906 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc1a1P51906 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc1a1P51906 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc1a1P51906 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc1a1P51906 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc1a1P51906 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms