Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,71
Defa-rs12P50716 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Defa-rs12P50716 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Defa-rs12P50716 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Defa-rs12P50716 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Defa-rs12P50716 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Defa-rs12P50716 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Defa-rs12P50716 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Defa-rs12P50716 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Defa-rs12P50716 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Defa-rs12P50716 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Defa-rs12P50716 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Defa-rs12P50716 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Defa-rs12P50716 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Defa-rs12P50716 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Defa-rs12P50716 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Defa-rs12P50716 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Defa-rs12P50716 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Defa-rs12P50716 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Defa-rs12P50716 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Defa-rs12P50716 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Defa-rs12P50716 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Defa-rs12P50716 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Defa-rs12P50716 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Defa-rs12P50716 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Defa-rs12P50716 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Defa-rs12P50716 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Defa-rs12P50716 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Defa-rs12P50716 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Defa-rs12P50716 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Defa-rs12P50716 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Defa-rs12P50716 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Defa-rs12P50716 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Defa-rs12P50716 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Defa-rs12P50716 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Defa-rs12P50716 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Defa-rs12P50716 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,64
Defa-rs12P50716 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Defa-rs12P50716 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Defa-rs12P50716 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Defa-rs12P50716 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Defa-rs12P50716 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Defa-rs12P50716 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Defa-rs12P50716 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Defa-rs12P50716 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Defa-rs12P50716 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Defa-rs12P50716 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Defa-rs12P50716 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Defa-rs12P50716 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Defa-rs12P50716 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Defa-rs12P50716 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Defa-rs12P50716 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms