Protein–RNA interactions for Protein: P50715

Defa-rs7, Alpha-defensin-related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs7P50715 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Defa-rs7P50715 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Defa-rs7P50715 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Defa-rs7P50715 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Defa-rs7P50715 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Defa-rs7P50715 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa-rs7P50715 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa-rs7P50715 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Defa-rs7P50715 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Defa-rs7P50715 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Defa-rs7P50715 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defa-rs7P50715 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa-rs7P50715 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs7P50715 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs7P50715 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa-rs7P50715 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa-rs7P50715 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa-rs7P50715 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa-rs7P50715 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa-rs7P50715 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa-rs7P50715 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa-rs7P50715 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs7P50715 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs7P50715 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs7P50715 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa-rs7P50715 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa-rs7P50715 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Defa-rs7P50715 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Defa-rs7P50715 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Defa-rs7P50715 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs7P50715 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs7P50715 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa-rs7P50715 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs7P50715 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs7P50715 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs7P50715 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs7P50715 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs7P50715 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Defa-rs7P50715 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Defa-rs7P50715 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs7P50715 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs7P50715 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs7P50715 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa-rs7P50715 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa-rs7P50715 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa-rs7P50715 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa-rs7P50715 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa-rs7P50715 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa-rs7P50715 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Defa-rs7P50715 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Defa-rs7P50715 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Defa-rs7P50715 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms